Transkriptomische Änderungen bei Alzheimer-Demenz

Im Rahmen meiner medizinischen Doktorarbeit und der Arbeit am Institut für Anatomie unter Prof. Ingo Bechmann habe ich zur Aufklärung mehrerer Fragen öffentlich verfügbare sowie eigens generierte Single Nucleus RNA Sequencing (snRNAseq)-Datensätze verwendet, um verschiedenen Fragen der Pathophysiologie der Alzheimer-Demenz zu begegnen.

Im Rahmen der Publikation „Detection of molecular markers of ferroptosis in human Alzheimer’s disease brains“ (Emily Mayr, Jonas Rotter, Heidrun Kuhrt, Karsten Winter, Ruth Martha Stassart, Wolfgang J. Streit, Ingo Bechmann), Vol. 102, Journal of Alzheimer’s Disease, konnte ich mithilfe von Gene Set Enrichment Analysis und Gene Set Variation Analysis von öffentlich zugänglichen snRNAseq-Datensätzen zeigen, dass Ferroptose-assoziierte Prozesse am Fortschreiten der Alzheimer-Demenz beteiligt sein könnten.

In einer Kooperation mit Matthias Megges, Robert Opitz und Peter Kühnen von der Charité Berlin konnte mithilfe von Hirnen aus Körperspenden ein snRNAseq-Datensatz erzeugt werden, welcher die Analyse der transkriptomischen Änderungen in der Anfangsphase der Alzheimer-Demenz erlaubt. Dies könnte Aufschlüsse über die Beteiligung seltener Zelltypen oder bestimmter zellullärer Prozesse geben, welche im Gegensatz zum gesunden Hirn verändert sein könnten.